慈禧在庚子国难前因列强干预废帝计划而迁怒洋人,联合载漪等顽固派利用义和团“扶清灭洋”运动对抗外国势力。载漪伪造列强要求慈禧归政的照会,激怒慈禧召开四次御前会议。光绪帝虽被囚禁仍力主镇压义和团,但慈禧最终决定宣战,颁布未明确宣战对象的诏书,并默许义和团合法化。
清军与义和团围攻外国使馆时,慈禧暗令荣禄虚张声势,同时秘密向使馆送粮送肉。八国联军攻陷天津后进逼北京,慈禧发现战局失控,紧急停战议和未果。在联军破城前夕,慈禧命崔玉贵将反对其决策的珍妃投入井中灭口,确保逃亡时无人威胁其权力。
1900年8月15日,慈禧携光绪、大阿哥等人乔装西逃。逃亡队伍在溃兵与义和团混战中艰难行进,沿途官员溃散,慈禧被迫依赖少数太监。经颐和园短暂停留时,慈禧斥责任用载漪导致战祸,光绪全程沉默,面对破碎山河与未知命运,清廷最高统治集团彻底失去对局势的控制。